各校計畫成果

活動簡介

癌細胞的轉移是現今癌症治療最具挑戰性的課題，若能夠提早預測腫瘤是否有轉移的可能性，就能更精準且及時針對患者進行治療與防範。過去研究多試圖以特定基因的表現來預測癌細胞的轉移，但這樣單一的判斷方式常常會遇到見樹不見林的困境，或是無法靈活應對腫瘤常有的個體差異性。當癌細胞準備轉移時，會產生上皮-間質細胞轉化(epithelial-mesenchymal transition, EMT)，由排列緊密、不易移動的上皮型癌細胞轉化成間質型癌細胞，細胞的排列會轉為鬆散且利於細胞爬行。過程中，「純上皮」細胞會先降低上皮型基因 (epithelial gene) 表現，形成稍不緊密「類上皮」細胞；再進一步便促進間質基因 (mesenchymal gene) 表現，細胞轉而形成爬行能力較強的「類間質」細胞，藉此逐步提升細胞侵襲周邊組織的能力，達到癌症轉移的目的。

黃韻如教授的五年期玉山計畫，旨在釐清在卵巢癌細胞轉移時，調控上皮－間質轉化光譜挪移的機轉，透過高維度體學分析的方法，來釐清癌細胞如何達成在不同狀態之間轉化。

黃韻如教授在108、109、110年度的計畫執行中，已在EMT機制的調控研究上取得重要的成果。在108年度黃教授與團隊已發現¹，穩定DNA 三維結構的蛋白Rad21，對於上皮－間質分化基因之啟動子（promoter）及增强子（enhancer）之間的交互作用，具有重要的調控功能。在109年度，黃韻如教授以唯一來自台灣的學者身分，參與國際EMT學會 ‘The EMT International Association (TEMTIA)’ 制定有關EMT研究的定義和指南²。此指南強化一個新的概念，建議使用 “上皮-間質可塑性”（Epithelial-Mesenchymal Plasticity, EMP）這個名詞，來描述細胞沿著上皮-間質光譜排列相互轉換的能力。在110年度，黃韻如教授團隊利用高維度捕獲染色質構象技術 (Hi-C) ³，發現了癌細胞的基因體三維立體結構在上皮-間質轉化光譜（EMT Spectrum）中，對於上皮基因（epithelial genes）以及間質基因（mesenchymal genes）存在著多元的調控機制，針對特定染色質區域的三維立體結構進行分析，可以預測這些癌細胞的狀態。在 111年度，黃韻如教授團隊延續在108年度發表的卵巢亮細胞癌(ovarian clear cell carcinoma, OCCC) 上皮表現型 (EpiCC)，以及間質表現型 (MesCC) 研究⁴，進一步聚焦在早期卵巢亮細胞癌的免疫表現型，透過分析臨床檢體的基因表現，發現具有熱免疫 (Immune-Hot) 特徵的腫瘤病患預後較差⁵，而具有這些免疫特徵的腫瘤也具有較高間質表現型的傾向，此發現進一步確立了 EMT機轉在人類卵巢亮細胞癌的臨床疾病進程上扮演重要的角色，也提供未來利用EMT機轉做為疾病預後推測以及精準治療的根據。

本年度，黃韻如教授團隊與台大醫院尤善琦醫師合作，透過空間體學技術，剖析全轉錄組分析，對比了單核細胞和對照B細胞，並根據基因表達譜來確定單核細胞的B細胞亞群⁶。這項研究鑑定出466個在單核細胞和對照B細胞之間差異表達的基因。上調基因的比較顯示，非典型記憶B細胞與單核細胞之間有最多的基因重疊，表現出與單核細胞類似的基因表達模式。此發現揭示了單核細胞與記憶B細胞，特別是非典型記憶B細胞之間的相似性，並且提供了有關單核細胞與邊緣區淋巴瘤之間基因表達差異的見解。這些發現對於理解B細胞的分化和功能具有重要意義，並可能對淋巴瘤的診斷和治療提供新的靶點。